LA SECUENCIA NUCLEOTIDICA COMPLETA DEL ARN GENÓMICO DEL VIRUS DEL MOSAICO COMÚN DEL FRIJOL (BEAN COMMON MOSA1C VIRUS) CEPA N L4

Abstract

Se determinó la secuencia completa del ARN genómico del Virus del mosaico común del fríjol (Bean common mosaic virus) cepa NL4 (BCMV-NL4). El genoma viral consta de 10037 nucleótidos excluyendo la cola de poli (A) y contiene una trama de lectura abierta (ORF) de 9666 nucleótidos que codifica una poliproteína de 3222 aminoácidos. La ORF está flanqueada por dos regiones no traducidas (UTR): la 5’UTR de 133 nucleótidos y la 3’UTR de 235 nucleótidos. Análisis comparativos de la poliproteína del BCMV-NL4 con otras especies del género Potyvirus, reveló nueve sitios de clivaje que resultaron en las diez proteínas funcionales características de estos virus. Alineamientos múltiples de las secuencias de nucleótidos del ARN genómico y de aminoácidos de la poliproteína del BCMV-NL4 con las de otros miembros de la familia Potyviridae mostraron una relación estrecha entre el BCMV-NL4 y el BCMV-NL1. Las comparaciones mediante el uso del programa Blast de las secuencias de la proteína de la cápsida (CP) y de la 3’UTR, mostraron una identidad del 100% entre el BCMV-NL4 y la variante mexicana (US6) de esta cepa.

The complete genomic RNA sequence of Bean common mosaic virus strain NL4 (BCMV-NL4) was determined. The viral genome consists of 10,037 nucleotides excluding the poly(A) tail and contains an open reading frame (ORF) of 9,666 nucleotides that encodes a polyprotein of 3,222 amino acids. The ORF is flanked by two untranslated regions (UTRs): the 133-nucleotide 5'UTR and the 235-nucleotide 3'UTR. Comparative analyzes of the BCMV-NL4 polyprotein with other species of the Potyvirus genus revealed nine cleavage sites that resulted in the ten functional proteins characteristic of these viruses. Multiple alignments of the nucleotide sequences of the genomic RNA and amino acid sequences of the BCMV-NL4 polyprotein with those of other members of the Potyviridae family showed a close relationship between BCMV-NL4 and BCMV-NL1. Comparisons using the Blast program of the capsid protein (CP) and 3'UTR sequences showed 100% identity between BCMV-NL4 and the Mexican variant (US6) of this strain.